إتفاق المعارضة السورية على عدم عتاب الشيخ البوطي كثيرا وتصميم أبرز قادتها على عدم تحميله أي مسؤولية في التورط مع النظام، رغم تصريحاته القاسية في حقهم لم يأت من فراغ ولم تلده الصدفة ولا الخوف من لحم العلماء المسموم. وإنما موقف صنعته جملة من المعطيات الخاصة جدا، والتي لا يعرفها الرأي العام، تؤكد أن الشيخ يتعامل مع الوضع في سوريا من منطلق قناعاته والتزاماته التي قد لا يوافقه عليها بعض العلماء الآخرين ويقاسمه فيها كثير من علماء الأمة الإسلامية.
فمثلا الشيخ البوطي من العلماء الذين يحرمون مشاهدة التلفزيون، وعليه فإن ما يملكه من تفاصيل وروايات لا تتعدى النقل على لسان أشخاص آخرين دون أن يكون قد شاهد بأم عينه أيا من مشاهد التقتيل والتنكيل بالأبرياء في حمص ودرعا ودير الزور وغيرها من المناطق التي يتجرع فيها الشعب السوري الويلات ويدفع في كل ثانية ضريبة ثورته من أجل الكرامة
.
ووفقا لشخصيات سياسية معارضة كثيرة فان الشيخ محمد سعيد البوطي يتحدث انطلاقا من المعلومات التي يقدمها له "زبانية" النظام في ظل الحراسة المضروبة عليه، والتي لا تمكن حتى تلامذته من التواصل معه بسهولة. وهو ما أكده بعض الناشطين السوريين في زيارة للشروق شباب سوريون من المتظاهرين حضروا لمبادرة مليون وردة أخذوها لبيته حاملين معهم رسالة له يشرحون له فيها سبب خروجهم للشارع، لكن الأمن السوري حال دون ذلك
.
محاولات كثيرة يصر عليها أبناء سوريا قادتهم إلى ملاحقة الشيخ في المسجد عقب أداء الصلاة ومحاولات أخرى أراد بها الشباب ترجمة مشاعرهم الثورية ضد كبت الحريات ومصادرة حقوق الإنسان في بلد إسلامي عربي قدم عبر التاريخ انتصارات وإنجازات حضارية لا حصر لها وصلت حد حرق كتبه وبيانات تنديدية من بعض رموز المعارضة حملته في بداية الثورة مسؤولية الدماء التي تسفك ظلما.
ولكن ما الذي ينتظره السوريون من شيخ جليل مقاطع للتلفزيون ومطلق بالثلاث كل أنواع التكنولوجيا التي من شأنها أن تنقل بالصوت والصورة حجم المجازر وبشاعتها. أو ماذا باستطاعة الشيخ البوطي الذي بنى له النظام قصرا من العزلة وأغرقه في بحر من التعتيم ثم ضرب عليه أسوارا وحراسة لا تخترق
.
والجدير بالذكر ان الشيخ محمد سعيد البوطي قد عبر عن أمله في أن تتحد القلوب وأن يتفق الجميع على حماية كل شبر من أرض سوريا، قائلا على هامش تشييعه لضحايا الانفجاريين "لا يمكن أن تمتد أيدينا للأعداء وأن نصافح من تلوثت يداه بالدماء متسائلا ما مدى فرح برهان غليون وصحبه الذين يصرون على أن لا يقبلوا أي إصلاح إلا إذا جاء من أعداء الله والإنسانية، مضيفا قلت إياكم أن تفتحوا باباً إلى منحدر ذي اتجاه واحد، الخطوة الأولى تبعثكم إلى الهاوية التي نرى مظهراً من مظاهرها الآن ومؤكداعلى أن الجيش السوري لا يمكنه أن يفجر أنابيب الغاز والنفط ولا يمكن أن يقتل أفراده
.